在遠古世界形成之時，在被稱作高天原的天邊出現了三位神。他們是天之禦中主神、高禦產巢日神和神產巢日神。 其時國土（大地）尚未凝成，只是些漂在水面上的浮油一樣的東西，如水母般漂浮不定。其中有物如春天的葦芽冒出，生命力極強，生長迅速，化作宇摩志阿斯訶備比古神和天常立神。其後又陸續生成了七對男女神，稱作神世七代。神世七代中最晚生成的一對神是伊邪那岐命男神和伊邪那美命女神。大地依舊未成形，如油脂漂浮不定。於是眾天神命令伊邪那岐命和伊邪那美命二神去加固國土，並授與他們天沼矛。 伊邪那岐命和伊邪那美命遵命來到懸浮於天地之間的天浮橋，將天沼矛插入下麵的漂浮物中，來回攪動，再將矛提起來，於是海水自矛尖滴下，聚積凝固形成一個島，即淤能棋呂島。二神降臨島上，修建了一座高大雄偉的宮殿。
一日，伊邪那岐命問伊邪那美命道：“你的身體發育得怎樣了？”
伊邪那美命回答道：“我的身體已經發育成熟，只是有一處沒有長合。”
伊邪那岐命說道：“我的身體也發育成熟，只是多出一處。讓我們結合在一起，生育國土吧。”
伊邪那美命欣然應允。二神相約分別自右向左和自左向右繞著宮殿粗大的柱子行走，相遇便結為夫妻。
於是男神從左向右繞行，女神自右向左繞行。當二神會合時，女神先說道：“好一位英俊的男子！”
男神隨即應道：“好一位漂亮的女子！”就這樣，二神完成了結婚儀式。不久，生下一個渾身沒有骨頭的水蛭子。二神不喜歡這個發育不健全的孩子，便把他放到用葦葉編的葦船上，讓他隨水漂走。之後，生下了淡島，此子也未被算在禦子之列。
二神商議道：“我們生下的孩子不健全，是什麼原因呢？我們一起去向天神請教請教吧。”
天神用焚燒鹿肩骨的占卜方法為二神占卜後說道：“那是由於女子先發話的緣故。女子先說則不吉。這次回去由男的先說再重新來一遍。”
伊邪那岐命與伊邪那美命回到淤能棋呂島，照以前的方法又重新繞柱走了一遍。這次二神相遇時，伊邪那岐命首先說道：“好一位美麗的女子！”
緊接著伊邪那美命才說道：“好一位英俊的男子！”
重新舉行了結婚儀式後，二神生得八島：淡路島；伊豫島 （今日的四國），此島一身生有四個面孔，每個面孔各有一個名字；隱岐島；築紫島（今日的九州），此島也是一身四面，每個面孔各有一個名字；伊伎島；對馬島；佐渡島和大倭豐秋津島（今日的本州）。此八島又稱作“大八島國”。 此後又生得六個小島，共計十四個島。
伊邪那岐命與伊邪那美命共同創造的這片國土，又稱葦原中國，是相對于高天原 （天上的世界）和黃泉國（地下的世界）而存在的人間的世界。
生完國土又生育諸神。房屋神、河神、海神、農業神、風神、原野神、山神、船神、火神等，共計生得三十五位神。
其間在生火神火之夜藝速男（又名火之炫毗古神，火之迦具土神）時，伊邪那美命陰部被燒傷，臥病不起。她的嘔吐物、糞便也分別化為幾位神。
伊邪那美命因生火神而被燒傷，不久便離開這個世界，到黃泉國去了。
男神伊邪那岐命失去了愛妻，悲傷萬分。他撲在妻子的屍身上哭泣道：“我的愛妻呀！為了那麼個小子竟失去了你，實在是太不值得了！”
男神哭泣時流出的眼淚化作泣澤女神。男神把伊邪那美命安葬於出雲國和伯耆國交界的比婆山下後，拔出腰間所佩的十拳劍，將致使伊邪那美命命歸黃泉的火神的鬥砍了下來，沾在劍尖、劍身、劍柄等處的血流下後，化出八位神。
被砍掉了腦袋的火神火之迦具土神的頭、胸、腹、陰部、左右手、左右腳也分別化作了山神、雨神、武器神等八位神。
伊邪那岐命思念著伊邪那美命，便隨後追到黃泉國。伊邪那美命自緊閉的黃泉國大殿的大石門內迎出來，伊邪那岐命對女神說道：“我們共同創造的國土尚未完成，無論如何請隨我回到世上來吧。”
女神回答說：“太遺憾了，你怎麼不早點來接我呢？我已經吃了黃泉國的飯食，無法返回你所在的世界了。不過，既然你特地來接我，我還是想與黃泉國的眾神商量一下，看能不能隨你回去。但是，在此期間你不許偷看。”
說完，伊邪那美命返身回到大殿中去，伊邪那岐命則等候在石門外。許久不見女神出來，伊邪那岐命漸漸焦躁起來，按捺不住，便取下插在左耳鬢的多齒木梳，將它的最粗一齒折斷，點上火製成火把，舉著它悄悄進入大殿。
借著火光仔細一看，只見伊邪那美命身上爬滿了蛆，頭部、胸部、腹部、陰部、左手、右手、左腿、右腿之上各坐著一雷神。伊邪那岐命見了驚恐萬分，拔腿而逃。伊邪那美命被丈夫看到了醜陋的形象，懊惱不已，立即派女鬼去追。
女鬼很快便要追上了，伊邪那岐命急中生智，把自己頭上戴的黑木藤編的藤圈朝身後扔去，那藤圈即刻化作一片野葡萄林。女鬼嘴饞貪吃野葡萄，伊邪那岐命便趁機跑遠了。女鬼吃了野葡萄，又緊追上來。
這次伊邪那岐命取下插在右耳鬢的木梳，將梳子齒掰斷扔向身後，剎時身後長出鮮筍。在女鬼貪吃鮮筍之際，伊邪那岐命又跑遠了。
最後，由伊邪那美命身體各部分生成的八雷神，率領黃泉國的魔軍追殺而來，伊邪那岐命拔出佩在腰間的十拳劍抵擋，邊揮舞邊逃，魔軍直追到黃泉國與葦原中國的分界處比良阪。伊邪那岐命從長在比良阪山坡下的桃樹上摘下三個桃子，朝追來的魔軍擲去，沒想到魔軍見了桃一下子便潰不成軍，四散而逃。
伊邪那岐命感激地對桃子說：“謝謝你們幫助了我。今後，生活在葦原中國的人們若身處困境，還請多幫助他們。”說完，封桃子為“意富加牟亞美命”。自此凡間流傳著桃木可避邪的說法。
伊邪那美命見幾次追殺都失敗了，便親自追來。伊邪那岐命推來一塊大石頭，擋在比良阪的路中。伊邪那美命無法繼續前行，隔著大石頭憤憤地說道：“既然如此，我將每天殺死一千名你的國人。”
伊邪那岐命答道：“要是那樣，我就每天建一千五百個產房，每天誕生一千五百個嬰兒。”
因為這個緣故，每天都有一千人死去，每天又都有一千五百 人誕生。
伊邪那岐命回到葦原中國後，覺得自己去了趟黃泉國，渾身沾滿了汙穢，便打算舉行祓濯儀式來去掉身上的汙穢之氣。
築紫國日向的橘小門的阿波岐原位於河的入海口處，岸邊桔樹葉青枝茂，陽光燦爛地照耀著，景色很美。
伊邪那岐命來到這裏，把身上的衣裳和飾物統統扔掉，裸著全身，准備跳進河裏好好清洗一下。他所扔掉的手杖、腰帶、圍在腰下的裙裳、內褲、帽子以及戴在左手和右手上的玉鐲，分別化成不同的神，一共生成了十二位神。
伊邪那岐命裸著身子，站在河邊觀察水勢，他自言自語道：“上游太湍急，下游太舒緩，就在河的中段吧。”
於是，跳進河的中段，潛入水中，細致地洗濯全身。
伊邪那岐命身上洗落的污垢共化成了四位神，他在水底、水中、水面洗濯時，分別生成了六位神。最後他上岸掬清水洗左眼，生成了太陽女神，即天照大禦神；洗右眼，生成了月亮女神，即月讀命；洗鼻孔，生成了速須佐之男命。
祓濯儀式完畢，伊邪那岐命渾身清爽，加之最後所得的三個孩子最稱心如意，心情非常高興。
“我最終總算得到三個孩子了！太令人高興了！”
於是，伊邪那岐命將自己脖子上戴著的可發出美妙聲響的玉串賜給天照大禦神，命令她道：“你去治理高天原！”
命令月讀命說：“你去治理夜國！”
最後對速須佐之男命說道：“你去治理大海！” 就這樣，伊邪那岐命將晝國、夜國和大海分別交由三個孩子治理。
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新修版2021/11月 (6)